El distintivo, concedido por la Fundación Europea para la Educación Ambiental y la Asociación de Educación Ambiental y del Consumidor, reconoce la calidad medioambiental y la labor formativa del puerto.
Para la concesión de la bandera se tienen en cuenta criterios de sostenibilidad ambiental, como la calidad del agua, la gestión de los residuos, la promoción del transporte sostenible, la restricción al tráfico o la eficiencia energética y en el uso del agua. Una gran inversión que sirve para que los usuarios disfruten de unas excelentes instalaciones.
Para el alcalde de Palos de la Frontera, este acto se ha convertido en una tradición para Mazagón ya que año tras año se reconoce el esfuerzo de todos por un puerto mejor y sostenible.
Con los años el Puerto Deportivo de Mazagón ha ido ganado prestigio, situándose como uno de los puertos punteros en toda la provincia. Una situación alcanzada gracias al esfuerzo de instituciones, trabajadores y ciudadanía.